Pulau Sulawesi
- Gorontalo: Gorontalo
- Sulawesi Barat: Mamuju
- Sulawesi Tengah: Palu
- Sulawesi Utara: Manado
- Sulawesi Tenggara: Kendari
- Sulawesi Selatan: Makassar
Pulau Maluku
- Maluku Utara: Sofifi (Pada awal pendirian, 4 Oktober 1999, ibu kota Maluku Utara adalah Ternate. Namun sejak 4 Agustus 2010, ibu kota dipindah ke Kota Sofifi.)
- Maluku: Ambon.
Pulau Papua
- Papua Barat: Manokwari
- Papua: Jayapura
- Papua Selatan: Merauke
- Papua Tengah: Nabire
- Papua Pegunungan: Jayawijaya
- Papua Barat Daya: Sorong.
(redaksi)
